Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB11FIP4Q86YS3 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB11FIP4Q86YS3 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms