Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TDRD12Q587J7 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms