Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms