Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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