Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NRF1Q16656 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms