Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
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SSX1Q16384 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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SSX1Q16384 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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SSX1Q16384 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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SSX1Q16384 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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SSX1Q16384 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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SSX1Q16384 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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SSX1Q16384 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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SSX1Q16384 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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