Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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CCDC6Q16204 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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CCDC6Q16204 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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CCDC6Q16204 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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CCDC6Q16204 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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