Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
USF2Q15853 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
USF2Q15853 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
USF2Q15853 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
USF2Q15853 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
USF2Q15853 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
USF2Q15853 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
USF2Q15853 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
USF2Q15853 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
USF2Q15853 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
USF2Q15853 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms