Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NPTX1Q15818 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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