Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNHIT3Q15649 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms