Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SHHQ15465 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SHHQ15465 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SHHQ15465 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SHHQ15465 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SHHQ15465 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SHHQ15465 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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SHHQ15465 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SHHQ15465 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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