Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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SYCP1Q15431 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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SYCP1Q15431 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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SYCP1Q15431 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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SYCP1Q15431 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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SYCP1Q15431 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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SYCP1Q15431 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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SYCP1Q15431 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SYCP1Q15431 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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