Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PCOLCEQ15113 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PCOLCEQ15113 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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