Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RFTN1Q14699 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms