Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SPIDRQ14159 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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SPIDRQ14159 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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SPIDRQ14159 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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SPIDRQ14159 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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SPIDRQ14159 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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SPIDRQ14159 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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SPIDRQ14159 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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SPIDRQ14159 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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SPIDRQ14159 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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SPIDRQ14159 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SPIDRQ14159 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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