Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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CKAP5Q14008 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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CKAP5Q14008 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CKAP5Q14008 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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CKAP5Q14008 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CKAP5Q14008 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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CKAP5Q14008 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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CKAP5Q14008 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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CKAP5Q14008 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CKAP5Q14008 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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