Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE7AQ13946 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE7AQ13946 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms