Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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