Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4AQ13619 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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