Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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BFSP2Q13515 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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BFSP2Q13515 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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BFSP2Q13515 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
BFSP2Q13515 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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BFSP2Q13515 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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BFSP2Q13515 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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