Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCIRG1Q13488 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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