Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
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ITGB3BPQ13352 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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ITGB3BPQ13352 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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ITGB3BPQ13352 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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ITGB3BPQ13352 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
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ITGB3BPQ13352 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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ITGB3BPQ13352 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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ITGB3BPQ13352 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGB3BPQ13352 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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