Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATMQ13315 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATMQ13315 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATMQ13315 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATMQ13315 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATMQ13315 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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