Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NME3Q13232 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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