Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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TRAF3Q13114 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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TRAF3Q13114 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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TRAF3Q13114 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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TRAF3Q13114 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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TRAF3Q13114 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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TRAF3Q13114 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
TRAF3Q13114 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
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