Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHAF1AQ13111 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms