Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
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PTPRBP23467 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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PTPRBP23467 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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PTPRBP23467 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
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PTPRBP23467 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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PTPRBP23467 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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