Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SPRR3Q9UBC9 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SPRR3Q9UBC9 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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