Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SMG1Q96Q15 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
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