Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC9Q96Q05 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.59□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms