Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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ZNF548Q8NEK5 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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