Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
OTOP3Q7RTS5 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.6 ms