Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
USP43Q70EL4 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
USP43Q70EL4 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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