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| ANKRD40 | Q6AI12 | DENND4A-202 | ENST00000443035 | 8665 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | snoU2_19.1-201 | ENST00000362361 | 80 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | Y_RNA.28-201 | ENST00000362554 | 111 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
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| ANKRD40 | Q6AI12 | AC099654.10-201 | ENST00000640395 | 161 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
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| ANKRD40 | Q6AI12 | CYLC1-201 | ENST00000329312 | 2106 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.98 | | |
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| ANKRD40 | Q6AI12 | ANP32BP3-201 | ENST00000559213 | 706 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
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| ANKRD40 | Q6AI12 | AC007485.1-201 | ENST00000616755 | 206 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | AC003984.1-201 | ENST00000450977 | 4104 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | AKAP9-203 | ENST00000359028 | 12247 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | SKIL-203 | ENST00000426052 | 2757 nt | TSL 2 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | ATP11C-201 | ENST00000327569 | 6115 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
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| ANKRD40 | Q6AI12 | Y_RNA.364-201 | ENST00000365532 | 101 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | RNU6-1032P-201 | ENST00000384100 | 107 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | TRAV41-201 | ENST00000390468 | 336 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | RNA5SP213-201 | ENST00000391031 | 106 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | MIR208B-201 | ENST00000401172 | 77 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | HMGB3P2-201 | ENST00000411913 | 584 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | AL445687.1-201 | ENST00000439946 | 251 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | AL359853.2-201 | ENST00000442108 | 353 nt | TSL 2 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
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| ANKRD40 | Q6AI12 | AC113383.1-204 | ENST00000507060 | 552 nt | TSL 3 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | RNU4-77P-201 | ENST00000516692 | 156 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | RRM2B-207 | ENST00000519962 | 201 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| ANKRD40 | Q6AI12 | EIF4A1P12-201 | ENST00000551910 | 141 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |