Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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KNOP1Q1ED39 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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