Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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