Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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SGCAQ16586 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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SGCAQ16586 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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SGCAQ16586 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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SGCAQ16586 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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SGCAQ16586 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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SGCAQ16586 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
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SGCAQ16586 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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SGCAQ16586 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
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SGCAQ16586 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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SGCAQ16586 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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