Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNF56Q15929 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.41
ZNF56Q15929 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.41
ZNF56Q15929 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF56Q15929 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF56Q15929 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF56Q15929 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF56Q15929 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF56Q15929 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNF56Q15929 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms