Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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