Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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CHD4Q14839 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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CHD4Q14839 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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CHD4Q14839 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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CHD4Q14839 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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CHD4Q14839 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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CHD4Q14839 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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