Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMCO1Q147U7 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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