Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SSPNQ14714 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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