Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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ERV3-1Q14264 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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ERV3-1Q14264 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERV3-1Q14264 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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