Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SCARF1Q14162 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 380.9 ms