Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
UBE4AQ14139 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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UBE4AQ14139 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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UBE4AQ14139 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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UBE4AQ14139 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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UBE4AQ14139 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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UBE4AQ14139 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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UBE4AQ14139 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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UBE4AQ14139 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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UBE4AQ14139 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
UBE4AQ14139 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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