| RUNX2 | Q13950 | MIR1244-2-201 | ENST00000636449 | 85 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1244-4-202 | ENST00000636813 | 85 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZBED5-202 | ENST00000432999 | 2741 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z82209.1-201 | ENST00000422141 | 2135 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF470-202 | ENST00000391709 | 6601 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.112-201 | ENST00000363250 | 102 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-8-201 | ENST00000363856 | 82 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP68-201 | ENST00000363885 | 119 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-38-201 | ENST00000365037 | 82 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP213-201 | ENST00000391031 | 106 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-48P-201 | ENST00000410694 | 191 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCYBP10-201 | ENST00000424905 | 650 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCYBP6-201 | ENST00000441810 | 138 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007215.1-201 | ENST00000464893 | 276 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018868.1-201 | ENST00000491307 | 315 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CKS1BP2-201 | ENST00000497342 | 240 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02064-201 | ENST00000506492 | 470 nt | TSL 5 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02501-201 | ENST00000510420 | 426 nt | TSL 2 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010210.1-203 | ENST00000513905 | 260 nt | TSL 3 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC074131.1-201 | ENST00000514662 | 253 nt | TSL 2 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-175P-201 | ENST00000515915 | 61 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003123.1-201 | ENST00000526041 | 333 nt | TSL 2 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000755.2-201 | ENST00000526777 | 571 nt | TSL 5 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004486.1-201 | ENST00000546846 | 233 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PWRN1-203 | ENST00000564898 | 389 nt | TSL 5 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4658-201 | ENST00000584344 | 65 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYP2C61P-201 | ENST00000604072 | 290 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RMDN2-203 | ENST00000402091 | 1973 nt | TSL 2 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DYNC2H1-202 | ENST00000375735 | 13678 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TBC1D31-206 | ENST00000518805 | 2201 nt | TSL 2 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCM1-222 | ENST00000524226 | 5955 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DNAH7-201 | ENST00000312428 | 12394 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TMPRSS11A-201 | ENST00000334830 | 3054 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-222P-201 | ENST00000362438 | 107 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.31-201 | ENST00000362574 | 102 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.132-201 | ENST00000363421 | 102 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U3.9-201 | ENST00000363823 | 204 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.252-201 | ENST00000364556 | 101 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR153-2-201 | ENST00000385225 | 87 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1093P-201 | ENST00000391194 | 107 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR190B-201 | ENST00000401119 | 79 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4ATAC16P-201 | ENST00000408512 | 126 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1156P-201 | ENST00000410365 | 100 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PMCHL1-202 | ENST00000423102 | 261 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MS4A4E-203 | ENST00000425663 | 350 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CBX3P6-201 | ENST00000430257 | 527 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KRTAP19-11P-201 | ENST00000439851 | 104 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CHEK2P4-201 | ENST00000450340 | 246 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000870.1-201 | ENST00000472927 | 406 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SRI-210 | ENST00000490437 | 570 nt | TSL 2 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108037.1-201 | ENST00000514103 | 423 nt | TSL 3 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-976P-201 | ENST00000516086 | 111 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-264P-201 | ENST00000517134 | 104 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELOCP31-201 | ENST00000540463 | 467 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ACTG1P17-203 | ENST00000561222 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007598.1-202 | ENST00000561528 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3670-2-201 | ENST00000582974 | 65 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3670-1-201 | ENST00000584160 | 65 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3670-3-201 | ENST00000584855 | 65 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNRPGP17-201 | ENST00000603780 | 214 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC100812.1-201 | ENST00000607622 | 580 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3670-4-201 | ENST00000612260 | 65 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC137590.2-201 | ENST00000619709 | 240 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138305.3-201 | ENST00000624988 | 240 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RTL4-201 | ENST00000340433 | 2613 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNX16-212 | ENST00000615066 | 1918 nt | TSL 5 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SENP7-205 | ENST00000394091 | 4434 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KTN1-203 | ENST00000395309 | 4021 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCOC-201 | ENST00000338517 | 1864 nt | TSL 4 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCSAP-202 | ENST00000366686 | 4399 nt | TSL 2 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.106-201 | ENST00000363189 | 100 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA38-201 | ENST00000363946 | 132 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.319-201 | ENST00000365138 | 92 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR592-201 | ENST00000384959 | 97 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR27B-201 | ENST00000385129 | 97 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-700P-201 | ENST00000391043 | 107 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLCL2-AS1-201 | ENST00000414844 | 311 nt | TSL 2 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO2P12-201 | ENST00000427426 | 682 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAGEA8-AS1-201 | ENST00000427671 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092423.1-201 | ENST00000430165 | 186 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073325.1-201 | ENST00000443714 | 542 nt | TSL 4 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U8.22-201 | ENST00000459141 | 133 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LEKR1-205 | ENST00000477399 | 621 nt | TSL 2 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092666.1-201 | ENST00000492054 | 573 nt | TSL 4 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01337-201 | ENST00000515871 | 440 nt | TSL 3 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP320-201 | ENST00000516263 | 124 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP148-201 | ENST00000516527 | 94 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-58P-201 | ENST00000517143 | 103 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EBAG9-207 | ENST00000531677 | 777 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC020661.2-201 | ENST00000560114 | 134 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CERS3-AS1-201 | ENST00000560643 | 372 nt | TSL 3 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3162-201 | ENST00000581818 | 82 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR6817-201 | ENST00000615588 | 66 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | WARS-244 | ENST00000627608 | 123 nt | TSL 5 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TAB3-205 | ENST00000378933 | 6671 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | APC-201 | ENST00000257430 | 10701 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL136360.1-201 | ENST00000503377 | 1900 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNY3P11-201 | ENST00000364153 | 102 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-301P-201 | ENST00000384277 | 107 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-308P-201 | ENST00000390957 | 107 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |