Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
RUNX2Q13950 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RUNX2Q13950 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms