Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CUL3Q13618 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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CUL3Q13618 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CUL3Q13618 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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CUL3Q13618 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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CUL3Q13618 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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CUL3Q13618 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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CUL3Q13618 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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CUL3Q13618 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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CUL3Q13618 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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CUL3Q13618 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CUL3Q13618 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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