Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IRF5Q13568 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.4 ms