Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TUBB3Q13509 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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