Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SMAD4Q13485 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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